DNA元件的標準化設計。為了最大化的降低對 DNA 片段的重新合成玖陽視覺，提高對已有 DNA 片段的利用率，合成生物學的一個重要研究方向是推進合成片段（生物元件）的標準化。上述提及的 BioBrick 就是標準化的實現形式之一，是合成生物學品牌活動領域最早建立的 DNA 標準化組裝方法。但是 BioBrick 法在被連接的元件之間留下的痕跡不利于蛋白元件的組裝。BglBrick 法就是為攤位設計解決 BioBrick 的缺陷而產生的標準化策略。我國王金課題組用歸位內切酶代替常規的 II 型限制性內切酶建立了 iBrick 標準，同時基于 CRISPR沈浸式體驗/Cpf1 技術開發了 C-Brick 拼接標準。基于 IIS 型限廣告設計制包裝設計性內切酶的Golden GateVR虛擬實境 標準，包括 MoClo和 GoldenBra廣告設計id 2.0，也能通過統一的方式進行元件的組裝。針對 Golden G活動佈置ate 等標準的不足，王金課題組建立了經典大圖 MASTER 連接法以實現更大片段的無縫克隆。此外，還奇藝果影像有與 iBirck 標準類似的 HVAS 法，道具製作與 MASTER 類似的 GreenGate 法等。不同的實驗室如果都按照上述的VR虛擬實境方式對生物元件進行標準化，將能促進生物元件的流通和共享，提高復雜生命系統合成的效率。
胞內組裝
盡管體外拼裝的片段大小可達幾百 kb，但是所得的量往往不足以進行后續實驗，需要使用大腸桿菌等進行擴增。對于 Mb（百萬堿基對）級別的體外組裝尚未見報道，即使假設能體外組裝成功，可能也無法導入到大腸桿菌內進行擴增互動裝置。而枯草芽孢桿菌、酵母及工程改造的部分細菌（超表達 T4 DNA 連接酶或整合 λRed 重組酶）等微道具製作生物本身就可以介導 D展覽策劃NA 的胞內重組連接，可直接將需要組裝的 DNA 片段導入這些宿主細胞內進行組裝。酵母作為常用的 DNA 重組宿主，其高效的同源重組FRP性能早在 40 多年前就已被發掘。1991 年，Silverman 等報道酵母可以實現長達 2 Mb 的人工染色體組裝。而 2010 年，玖陽視覺Gibson 等報道合成世界上第一個人造生命體，其長達 1.1 Mb 的合成基因組也是由酵母拼裝獲得。借助于模型酵母強大的同源重舞臺背板組能力，Sc2.0 項目（大型公仔酵母基因組合成計劃）展場設計利用 SwAP-In 的方法實現了天然染色體的置換，獲得完全合成的人工染色體。2018 年 8 場地佈置月，Shao 等報道其將釀全息投影酒酵母 16 條染色體合并為 1 條長度達 11.8 Mb 的染色FRP體，并獲得有正常功能的單染色體酵母菌株。帶有 1 條染色體的酵包裝設計母，可作為一個新的研究平臺，增進我們對染色體重組、復制和分離機制的解析，具有重要的意義。此外，該研究的結果也說明釀酒酵母對染色體長度驚人的容忍度（至少可以長包裝設計達 12 Mb），這為利用酵母攤位設計構建高等生物的超長染色體提道具製作供了理論依據，有利于后續 GP-大型公仔write 項目（基因組編寫計劃）的開展。
發佈留言